南沙港区地处于珠江三角洲的几何中心，是广州市城市空间发展战略中"南拓"的一个重要组成部分，是广州市未来重点发展的"三大港"(即深水港、航空港、信息港)中的深水港，也是广州市未来重点建设的"四个物流中心"之一。 南沙港区采用挖入与顺岸相结合的布局形式，规划布置5万吨级以上深水泊位34个，可利用岸线长20多公里，可以停靠8000~12000TEU的大型集装箱船舶，以外贸集装箱运输为主，并承担能源、液体化工、原材料运输以及保税、物流、商贸、临港工业开发的综合型深水港区。 截至2016年3月底南沙港区已开通65条国际航线增加了班轮密度，53条"穿梭巴士"集装箱驳船支线已基本覆盖珠三角港口群，15个无水港已将集货敛货体系辐射到泛珠领域，并积极推行国际AEO互认制度，建立了粤港跨境货栈(超级中国干线)。这些措施的实施，实现口岸信息共享和查验结果互认，增强了对国内国际两个市场航运资源的吸附力和配置能力。2015年南沙港实现货物吞吐量2.82亿吨，同比增长11.7%;集装箱吞吐量1177万标箱，同比增长6.3%，单个港口排全球前12位。 2022年7月28日，广州港南沙港区四期全自动化码头正式投入运行。